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本系大學部學生分為物理組與光電物理組,而研究所碩士班學生則分物理組、應用物理組及光電物理組。
在課程設計上,一、二年級課程多屬必修,其中普通物理、普通物理實驗、理論力學、電磁學及實驗物理課程是作為其他專門課程的知織基礎。三年級起,除少數必修課外,所有課程皆為選修。

本系學生畢業時須修滿一百二十八學分,成績優異的學生可以提前在三年內畢業,也可經由甄試直升本系碩士班。

由於選課極具彈性,導師會針對學生的志趣及過去修課情形,指導學生於本系內或他系的課程中作最佳選擇,以期對畢業後的發展有所助益。

大學部專業必修課程--物理組與光電物理組比較表
 
物理組
光電物理組
一年級
普通物理(一、二)、普通物理實驗(一二)
普通化學(一、二)、普通化學實驗(一二)
微積分(一、二)、應用數學()
二年級
上學期
理論力學()、電磁學()、應用數學() 、實驗物理
二年級
下學期
理論力學()、電磁學()、物理實驗技術 電磁學()、應用電子學()、物理實驗技術
三年級
上學期

量子物理()、熱統計物理()

近代物理實驗 

量子物理()、熱統計物理()

光學()、應用電子學()、應用電子學實驗 
三年級
下學期
量子物理() 量子物理()、光學()、光學實驗、光電物理導論